禪定寺內(nèi)原設(shè)有參尼、居巴、薩里瓦、謙巴四大扎倉。禪定寺最高負責人為僧綱，總攬全寺宗教教育、行政、司法等項事務(wù)。僧綱為世襲。僧綱之下設(shè)三套組織，一是戴哇雄，簡稱"戴"（即僧官衙門）。下設(shè)大小頭目，大頭目主管本寺部分行政事務(wù)，代表寺主辦理屬寺事務(wù)。大頭目下設(shè)班頭兩人，負責監(jiān)察全寺僧人持戒情事，班吏 5-10人，負責遞送通知，傳人等雜務(wù)。二是坐莊喇嘛辦事處，簡稱"喇",即通稱的赤哇，管理全寺宗教、法事活動。三是尚署組織是吉哇辦公處（卓尼方言讀吉西）簡稱"西",是辦理本寺各學院事務(wù)的行政機構(gòu)。

　　從五幢佛殿到三大學院，傾聽著格桑道德喇嘛講述古寺的歷史，回到寺門樓，仰望中國佛教協(xié)會會長、書法大師趙樸初先生為寺門書額的"禪定寺",已過去四個小時。夕陽西下，暮色蒼茫，我不知道自己是怎么在那份依依不舍的情愫里距禪定寺遠來越遠了，很明顯地，我是將一種難以說清的情感存放在了那里，禪定寺佛堂屋頂上小喇嘛凝視的眼神，成了我回到城市后一種抹不去記憶……