色林錯位于羌塘高原南部、扎加藏布下游終點，海拔4530米，面積1640平方公里，是西藏第二大湖。流域面積45530平方公里，居西藏內(nèi)陸水系首位。流域內(nèi)有許多河、湖串通，組成了一個內(nèi)陸湖群。歷史上湖面曾達1萬平方公里左右，但正面臨著旱化、礦化、湖面退縮的過程。與藏北其他湖泊相比，流域內(nèi)水網(wǎng)密度較大。主要入湖河流有扎加藏布、扎根藏布、波曲藏布等。扎加藏布全長409公里，是西藏最長的內(nèi)流河，發(fā)源于唐古拉山，于色林錯北岸入湖。河水年平均流量為26.7立方米／秒，夏季深度2-2.5米，春季深度0.5-1米。

　　色林錯亦為大型深水湖，湖心區(qū)水深在30米以上，透明度7-8，礦化度18.3-18.8克／升，屬咸水。