1016年，甘州回鶻突然殺入涼州。1032年9月，黨項人派李元昊率軍征討，終于打敗回鶻，把涼州納入西夏版圖。就這樣，經(jīng)過與六谷吐蕃、回鶻、北宋近30年的反復(fù)爭奪，黨項族人終于牢固地占據(jù)了涼州，并于1036年設(shè)置了西涼府，從此統(tǒng)治涼州達(dá)190多年。
原來占據(jù)涼州的吐蕃六谷部無力抵抗西夏，歸附青海吐蕃宗哥部。此后，他們以宗哥為根據(jù)地，在涼州一帶和西夏進行了近40多年的拉鋸戰(zhàn)。為了加強對涼州的防御能力，防止吐蕃的進攻，1068年5月，西夏對涼州城垣及周圍寨堡進行了大規(guī)模的修建，涼州從此固若金湯，真正成為西夏輔郡。
蒙古滅夏
成吉思汗建立蒙古政權(quán)后，先后6次進行對西夏的征服戰(zhàn)爭。1205年，成吉思汗統(tǒng)軍首次進攻西夏，從此拉開了六戰(zhàn)西夏的帷幕。此后，在1207年、1209年、1217年、1223年先后發(fā)動對西夏的戰(zhàn)爭。最后一次滅夏戰(zhàn)爭開始于公元1226年正月，成吉思汗以西夏收納其仇人亦剌合桑昆、西夏不送質(zhì)子、拒絕派兵從征等為借口，親自率領(lǐng)大軍進攻西夏。此役，成吉思汗決定分兵兩路進攻西夏，西路軍從西域借道畏兀兒東進，攻打賀蘭山以西河西走廊沙、肅等州，成吉思汗親率東路大軍攻打賀蘭山以東西夏腹地。
蒙古西路軍長驅(qū)直入，在大將阿答赤的率領(lǐng)下，連續(xù)攻占肅州、甘州，兵鋒直指西涼府。西涼府為西夏輔郡，戰(zhàn)略地位十分重要，西夏派遣名將斡扎簀鎮(zhèn)守西涼府。斡扎簀是西夏宰相斡道沖之子，善于用兵，且深明大義，愛民如子，在西涼府軍民中有著很高的威信。
七月，蒙古大軍直逼涼州城下。西涼城固若金湯，府庫之糧，足以供需一年之久。于是蒙古先派使者進城進行勸降。守將斡扎簀一面看到城外殺氣騰騰的蒙古軍隊，一面看到城內(nèi)手無寸鐵的黎民百姓，感到大勢已去，抵抗無果，決定保全百姓，投降蒙古，獻出城池。蒙古軍隨即占領(lǐng)涼州。
蒙古占領(lǐng)涼州初期，仍沿襲西夏舊制，以涼州為西涼府。元世祖至元十五年（1278年），元朝在涼州城西北30里的永昌府設(shè)立永昌路，降西涼府為州，隸屬永昌路。
馮勝平西
明朝洪武初年，包括武威在內(nèi)的甘肅大部地區(qū)仍被北元勢力控制。洪武五年（1372）正月，朱元璋派大將馮勝率領(lǐng)五萬大軍西征，這是明軍第二次北征沙漠之戰(zhàn)。
六月，馮勝和左副將軍陳德、右副將軍傅友德率領(lǐng)大軍到達(dá)甘肅蘭州。
當(dāng)時，元將失刺罕鎮(zhèn)守涼州（今甘肅武威），成為擋在明軍面前的第一道屏障。明軍只要攻克涼州，便可沿河西走廊長驅(qū)北上。馮勝思慮再三，決定分兵征伐，他把最精銳的5000名騎兵交給右副將軍傅友德指揮，命他帶兵北上。
傅友德是一位善于長途奔襲、速戰(zhàn)速決的優(yōu)秀將領(lǐng)，他充分發(fā)揮騎兵能快速突擊的優(yōu)勢，率領(lǐng)5000騎兵，以急行軍的方式奔襲涼州。當(dāng)傅友德的騎兵仿佛從天而降來到?jīng)鲋莩窍聲r，元將失刺罕驚慌失措，猝不及防，匆忙組織元兵抵抗，但無法阻擋傅友德騎兵的沖擊，失刺罕大敗，率領(lǐng)殘兵敗將棄城而去，明軍遂占領(lǐng)涼州。
當(dāng)時，元朝在河西設(shè)有軍政機構(gòu)永昌路，駐永昌（今甘肅永昌縣），如果占領(lǐng)永昌，將在心理上給予對河西的元軍以沉重的打擊。先鋒傅友德當(dāng)機立斷，決定不給元軍以喘息之機，便馬不停蹄，率軍乘勝進逼永昌，又擊潰元太尉朵兒只巴的軍隊，大獲其輜重、牛馬。而后，明軍連下甘州、肅州以及瓜州、沙州，“至十月，甘肅皆平。”
傅友德率軍收復(fù)涼州后，馮勝見涼州守備空虛，便抽調(diào)蘭州等衛(wèi)的官軍駐守武威，并逐步加強軍事配置力量，并于四年后設(shè)置了涼州衛(wèi)，配置軍力5600人。
賀錦西征
1643年，李自成的農(nóng)民起義軍乘勝追擊，連克潼關(guān)、西安。李自成派將軍賀錦隨劉宗敏、袁宗第等西向追擊白廣恩部官軍。寧夏等地平定之后，李自成乃命劉宗敏返回西安，準(zhǔn)備大舉東征，而完成西征甘肅、青海的任務(wù)就落到了部將賀錦的身上。
十一月，賀錦領(lǐng)兵向甘肅進發(fā)，一舉攻克安定，金縣開門迎降，兵鋒直抵蘭州。明朝甘肅總兵馬爌、副將歐陽袞等人見形勢危急，勸肅王朱識鋐西奔張掖，固守待援。朱識鋐妄想固守蘭州，沒有采納，馬爌等人便自行逃往甘州。十一月二十一日，賀錦所部義軍到達(dá)蘭州，蘭州百姓開城迎接。肅王朱識鋐倉皇逃出城外，被明朝卸任總兵楊麒派人擒獲，當(dāng)作自己投誠義軍的見面禮。賀錦厭惡他賣主求榮，不僅處死了肅王，也把楊麒父子斬首。
賀錦留下黨守素鎮(zhèn)守蘭州，自己統(tǒng)兵繼續(xù)西進。莊浪衛(wèi)沒做抵抗，便投降起義軍，賀錦前鋒直逼涼州衛(wèi)。明總兵郭天吉急忙調(diào)兵救援，調(diào)集涼州、永昌、民勤之兵，拼死防守，義軍前鋒力攻不克，后賀錦主力到達(dá)，遂攻陷涼州，即設(shè)官治理。
占領(lǐng)涼州后，義軍進軍張掖。甘肅巡撫林日瑞、總兵馬爌等人組織頑抗。十二月，義軍踏冰過河，直抵城下。當(dāng)時寒冬積雪深盈丈，守城官軍怨言四起。起義軍戰(zhàn)士卻不顧嚴(yán)寒，積極準(zhǔn)備攻城。十二月二十七日，守城部分官兵倒戈，義軍勝利地奪取了張掖城，林日瑞、馬爌等都被處死。占領(lǐng)甘州之后，酒泉等地官兵放棄城池而逃。
賀錦在各府州縣派設(shè)了官員，安撫地方，甘肅全境遂處于大順政權(quán)管轄之下。1645年正月，賀錦在平定青海的過程中，不幸被反動土司殺害。
涼州事變
1928年6月13日，國民軍教導(dǎo)團團長劉志遠(yuǎn)率領(lǐng)少數(shù)官兵占領(lǐng)涼州鎮(zhèn)守使衙門，盤踞涼州多年的原鎮(zhèn)守使馬廷勷出逃。馬廷勷逃到永昌皇城灘后，不甘心自己經(jīng)營十多年來的涼州就這樣輕易落于人手，發(fā)誓報復(fù)。不久，他在西寧鎮(zhèn)守使馬麒的幫助下，率領(lǐng)一萬多人，反攻涼州。
7月20日（農(nóng)歷六月初四），馬廷勷率部出祁連山老虎口，從永昌皇城灘方向進攻涼州。當(dāng)時涼州城防空虛，劉志遠(yuǎn)和所帶的少數(shù)官兵，也東調(diào)永登防守，守城軍隊只有從軍馬場調(diào)來的韓風(fēng)璋部數(shù)百人，以及幾百民團。21日早四時左右，馬廷勷部從西南城角利用云梯爬上城墻，與守城士兵和民團展開了激烈的爭奪戰(zhàn)。在城上經(jīng)過戰(zhàn)斗之后，守軍終因眾寡懸殊，紛紛潰退?？h長張東瀛身負(fù)重傷，被營救出城后藏在東岳臺附近的大麻地里，最終被馬廷勷的追兵搜出，割下首級掛在東門上示眾。韓風(fēng)璋見大勢已去，遂于當(dāng)天下午撤出部隊。后來，韓風(fēng)璋被劉郁芬以失陷涼州而槍斃。其余守城民團無處可逃，最后退守到北城門樓。北城門樓是在1927年武威大地震中，唯一沒被震塌的城樓。馬廷勷部眼見一時不能攻下，便下令燒毀北城門樓，樓上的守軍約五百人同時被燒死。這座在大地震中幸存下來、屹立在武威城的明朝建筑，就這樣毀于戰(zhàn)火之中。
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