1875年5月3日，清政府任命左宗棠以欽差大臣督辦新疆軍務(wù)。

    19世紀60年代，中亞浩罕汗國軍官阿古柏侵入我新疆，建立起軍事殖民統(tǒng)治，英俄爭相利用阿古柏政權(quán)作為自己分裂肢解中國領(lǐng)土的工具，俄國甚至在70年代初悍然出兵占領(lǐng)伊犁；同時美日對臺灣的侵略戰(zhàn)爭也相繼發(fā)生。到70年代中期，中國西北邊疆與東南海防頓形緊張，邊疆危機嚴重。清政府內(nèi)部在“海防”和“塞防”問題上卻出現(xiàn)了不同意見。李鴻章借口海防、塞防力難兼顧，公然主張放棄新疆，“移西餉以助海防”.認為“新疆不復，于肢體之元氣無傷；海疆不防，則心腹之大患愈棘”.

    李鴻章反對出兵收復新疆，其原因一是左宗棠鎮(zhèn)壓了陜甘回民起義，在統(tǒng)治集團中聲望日高，淮系軍閥要借此壓抑他；二是李鴻章正籌備興辦北洋海軍，要用海軍來鞏固淮系軍閥也就是他自己的地位；同時，這也合于英國反對清軍西征，以免它的走狗阿古柏復滅的企圖。湖南巡撫王文韶等認為，沙俄威脅最大，主張“塞防”為主，以全力注重西北。左崇棠則認為海防、塞防兩者并重，不可偏廢。抨擊李的主張是“自撤藩籬”.他強調(diào)“重新疆者，所以保蒙古，保蒙古者，所以衛(wèi)京師”.左宗棠鎮(zhèn)壓過太平天國運動和西北回民起義。但在民族危機日益加深的形勢下，挺身而出，能以“邊荒艱巨為己任”,不僅說明他著眼全局，目光遠大，而且具有平叛亂和反侵略的雙重意義，因而得到國內(nèi)愛國輿論的支持。清廷權(quán)衡利弊，采納了左宗棠的主張。3日任命他督辦新疆軍務(wù)，出兵西征，收復新疆。