迄今最全面人類基因組測序完成

 

 

    20年前，科學(xué)家宣布讀取了一個人的全部脫氧核糖核酸（DNA），其實，他們漏掉了少許?，F(xiàn)在，由于讀取DNA方法的改進，科學(xué)家終于可以從頭到尾讀取人類的全部基因組了！據(jù)生物預(yù)印本網(wǎng)站（biorxiv）近日報道，美國科學(xué)家對全部人類基因組30.55億個堿基對進行了測序，與此前結(jié)果相比，新結(jié)果增加了2億個堿基對以及2000多個基因。

 

 

     人類擁有數(shù)萬個基因，它們儲存于DNA分子中，基因信息以4種堿基（C、G、T和A）的形式存在，兩個堿基相互配對形成堿基對。

 

 

    科學(xué)家于1990年啟動了人類基因組測序項目，并于2001年公布了首個人類基因組草圖。但當(dāng)時不得不將基因組分成小段讀取，然后重新組裝在一起，而這樣無法將一些高度重復(fù)的片段放回原位。隨后遺傳學(xué)家繼續(xù)改進，但重點還是放在提高現(xiàn)有序列的精確度，而非增加新序列，仍有約8%的序列缺失或錯誤。

 

 

    新版本基因組由“端粒到端粒”（T2T）聯(lián)盟繪制。該聯(lián)盟由加州大學(xué)圣克魯斯分校的卡倫·米加和國家人類基因組研究所的亞當(dāng)·菲利皮領(lǐng)導(dǎo)。

 

 

    研究人員選擇從一個被稱為CHM13的細胞系中讀取DNA.該細胞系來自水泡狀胎塊--一種妊娠失敗情況，可以在實驗室中培養(yǎng)這種細胞。菲利皮說：“CHM13的獨特之處在于，它不是任何人的基因組。”

 

 

    普通人類細胞的每段DNA都有兩個副本，往往存在重大差異，一個來自母親，另一個來自父親，這使得對DNA精確測序變得更加困難，因為要搞清楚什么是測序過程中的失誤、什么是真正的差異非常棘手。使用CHM13避免了這個問題，因為兩個副本幾乎完全相同。

 

 

    為組裝基因組序列，研究團隊利用了兩種技術(shù)：一種是能讀取非常長（超過100萬個堿基對）片段的測序技術(shù)；另一種是精確度極高、能處理差別極小的片段（比如同一個基因的多個副本）的技術(shù)。

 

 

    2020年7月，該團隊公布了完整的決定性別的人類X染色體。現(xiàn)在，他們公布了完整的人類基因組，新版本比上一個版本增加了近2億個堿基對以及2226個新基因，是自人類參考基因組首次發(fā)布以來進行的最大改進。